อายุการเก็บรักษาของน้ำมันหอมระเหยจะแตกต่างกันไปขึ้นอยู่กับแหล่งที่มา องค์ประกอบ และสภาพการเก็บรักษา แต่โดยทั่วไปแล้วน้ำมันหอมระเหยมักจะเก็บไว้ได้นานกว่าผลิตภัณฑ์เครื่องสำอางทั่วไป น้ำมันหอมระเหยจากดอกไม้และซิตรัสส่วนใหญ่-เช่น กุหลาบ ดอกมะลิ และมะนาว-มีสารประกอบที่ระเหยง่ายหรือออกซิไดซ์ได้ง่าย ดังนั้นจึงมีอายุการเก็บรักษาค่อนข้างสั้น โดยทั่วไปจะอยู่ในช่วงหนึ่งถึงสามปี น้ำมันหอมระเหยที่เป็นเนื้อไม้หรือเรซิน-เช่น ไม้จันทน์ ไม้ซีดาร์ และกำยาน-มีสารประกอบอะโรมาติกที่เสถียร ทำให้สามารถคงอยู่ได้เป็นเวลาห้าถึงสิบปีหรือนานกว่านั้นด้วยซ้ำ
อายุการเก็บรักษาของน้ำมันหอมระเหยยังได้รับอิทธิพลอย่างมากจากสภาวะการเก็บรักษาอีกด้วย การหลีกเลี่ยงแสงแดดโดยตรง อุณหภูมิสูง และการสัมผัสกับอากาศเป็นสิ่งสำคัญในการยืดอายุการใช้งานของน้ำมัน โดยทั่วไปแนะนำให้เก็บน้ำมันหอมระเหยไว้ในขวดแก้วสีเข้มที่มีฝาปิดมิดชิด และเก็บไว้ในที่แห้งและเย็น เมื่อใช้น้ำมัน พยายามใช้หยดที่สะอาดหรือถือด้วยมือที่สะอาดเพื่อป้องกันการปนเปื้อนของสิ่งที่อยู่ภายใน การปฏิบัตินี้ช่วยรักษากลิ่นหอมและสารประกอบออกฤทธิ์ได้อย่างเต็มที่
แม้แต่น้ำมันหอมระเหยคุณภาพสูง-ก็อาจพบว่ากลิ่นหอมลดลง ความคงตัวทางเคมีลดลง และมีประสิทธิภาพในการรักษาลดลงเมื่อเลยวันหมดอายุไปแล้ว ขอแนะนำให้ตรวจสอบสี กลิ่น และความสม่ำเสมอของน้ำมันหอมระเหยเป็นประจำ หากสังเกตเห็นความขุ่น กลิ่นผิดปกติ หรือมีตะกอน ควรหยุดใช้ มีเพียงการเก็บรักษาที่เหมาะสมและการใช้งานอย่างทันท่วงทีเท่านั้นจึงจะสามารถมั่นใจได้ว่าน้ำมันหอมระเหยจะยังคงอยู่ในสถานะที่เหมาะสมที่สุดเพื่อให้เกิดประโยชน์ตามธรรมชาติอย่างเต็มที่
